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DiskGenius“重建分區表”功能是在原DOS版的基礎上重寫并增強的功能。它能通過已丟失或已刪除分區的引導扇區等數據恢復這些分區，并重新建立分區表。出現分區丟失的狀況時，無論是誤刪除造成的分區丟失，還是病毒原因造成的分區丟失，都可以嘗試通過本功能恢復。
分區的位置信息保存在硬盤分區表中。分區軟件刪除一個分區時，會將分區的位置信息從分區表中刪除，不會刪除分區內的任何數據。本軟件通過搜索硬盤扇區，找到已丟失分區的引導扇區，通過引導扇區及其它扇區中的信息確定分區的類型、大小，從而達到恢復分區的目的。
本功能操作直觀、靈活、搜索全面，在不保存分區表的情況下也可以將搜索到的分區內的文件復制出來，甚至可以恢復其內的已刪除文件。搜索過程中立即顯示搜索到的分區，可即時瀏覽分區內的文件，以判斷搜索到的分區是否正確。
要恢復分區，請先選擇要恢復分區的硬盤。選擇硬盤的方法有：
1、點擊左側“分區、目錄層次圖”中的硬盤條目，或硬盤內的任一分區條目。 2、點擊界面上部“硬盤分區結構圖”左側的小箭頭切換硬盤。
如果僅需要搜索空閑區域，請在“硬盤分區結構圖”上點擊要搜索的空閑區域。
選擇好硬盤后，點擊“工具 - 搜索已丟失分區(重建分區表)”菜單項，或在右鍵菜單中選擇“搜索已丟失分區(重建分區表)”。程序彈出“搜索分區”對話框：
可選擇的搜索范圍有：
1、整個硬盤：忽略現有分區，從頭到尾搜索整個硬盤。 2、當前選擇的區域：保留現有分區，并且只在當前選擇的空閑區域中搜索分區。 3、所有未分區區域：保留現有分區，并且依次搜索所有空閑區域中的已丟失分區。
另外，如果能確信要恢復的分區都是按柱面對齊的，則可以勾選“按柱面搜索(分區按柱面對齊)”選項。這樣能提高搜索速度。一般情況下，XP及以前的系統在分區時均是按柱面對齊的，Vista及以后的系統不再按柱面對齊了。
設置好搜索選項后，點擊“開始搜索”按鈕。程序開始搜索過程。
搜索到一個分區后，本軟件立即在界面中顯示剛剛搜索到的分區，并彈出下面的提示信息：
此時，如果搜索到的文件內有文件，程序會自動切換到文件瀏覽窗口并顯示分區內的文件列表。用戶可據此判斷程序搜索到的分區是否正確。可以不關閉搜索到分區的提示。即可在主界面中查看剛剛搜索到的分區內的文件。如果通過文件判斷該分區不正確，請點擊提示對話框中的“忽略”按鈕。如果分區正確，請點擊“保留”按鈕以保留搜索到的分區。點擊保留后，程序不會立即保存分區表(不寫硬盤)。繼續搜索其它分區，直到搜索結束。有時候對話框中還會有一個“這是一個主分區”或“這是一個邏輯分區”的選項。如果DiskGenius顯示的主分區或邏輯分區類型不正確，可以通過勾選此選項進行轉換。
搜索完成后，程序彈出下面的提示：
搜索完成后，在不保存分區表的情況下，可以立即利用本軟件訪問分區內的文件，如復制文件等。甚至恢復分區內的已刪除文件。但是只有在保存分區表后，搜索到的分區才能被操作系統識別及訪問。
如果想放棄所有搜索結果，請點擊“硬盤 - 重新加載當前硬盤”菜單項。
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